需要试剂:
氯仿、异丙醇、75%乙醇(用DEPC水配制)、RNase-free水。
操作步骤:
1、样本处理
1)贴壁细胞:吸尽培养液,每10平方厘米(6孔板孔或35mm平皿)细胞加入1mL 高效TRIZOL裂解液,使其覆盖培养细胞,再用吸管或加样器吹打2~3次,细胞应完全裂解,然后转移至离心管中。
2)悬浮细胞:离心收集细胞,吸尽液体,每五百万至一千万(5X105-1X107)动植物或酵母细胞,或一千万(1X107)细菌,加入1mL高效TRIZOL裂解液。用吸管或加样器吹打,使其完全裂解。某些酵母和细菌如裂解不充分,可用匀浆器匀浆,以确保其完全裂解。转移至离心管中。
3)组织:先将组织剪切成小块,放入玻璃匀浆器内。冷冻组织可在研钵中研磨匀浆。每50-100mg组织加入1mL 高效TRIZOL裂解液,匀浆至完全裂解。转移至离心管中。
裂解产物应呈澄清的透明粘稠液体。室温放置5分钟。对于多糖、蛋白等杂质丰富的组织样品,匀浆后仍会存留有不溶物质,可12000g4°C离心10分钟,然后吸取上清至一新的离心管中。
2、相分离
加入0.2ml的氯仿,加盖好后用手剧烈摇晃15s,在15-30°C放置2-3min,然后离心12,000xg,15min;离心后分成三层,取上层水相。RNA只存在于水相中,水相占总体积的60%。
3、RNA沉淀
将上层水相转移到另一干净的EP管中,加入0.5ml异丙醇,15-30C,静置10min,然后12,000xg,4C离心10min。离心前可以在管的侧壁和底部看到絮状胶样沉淀,这就是RNA沉淀。
4、RNA洗涤
去上清,加入1ml75%乙醇洗涤RNA沉淀,振荡器混匀,7,500xg,4C离心5min.
5、RNA再溶解
去上清,置真空或空气中5-10min,干燥RNA沉淀。注意不能将RNA沉淀完全干燥,这样会极大地降低它的溶解度。部份溶解的RNA样品其A260/280比值<1。用无RNase水或0.5%SDS溶液重悬RNA沉淀,用枪头反复吹打几次,55-60°°C,静置10min。测浓度后-20°C保存。
6、测浓度
取2μl储存液加入另一个EP管中,再加入98ul无RNase水,离心混匀,以无RNase水作空白对照,测OD260/280值。0D260/280值在1.8-2.0视为纯度很高。·一般浓度在1000ng/ul较准。浓度太高要稀释以后再测定。·RNA鉴定:琼脂糖电泳,确定抽提RNA完整性和DNA污染情况。
注意事项:
在使用高效TRIZOL裂解液的时候要带手套和眼罩,避免接触到皮肤和衣服,
使用化学通风橱,防止蒸汽吸入。
除非特别说明,所有的操作均在15-30°C下进行,所用的试剂均放置于15-30°C。
组织在加入氯仿之前是可以在-60至-70°C放置一个月。RNA沉淀在75%乙醇中在2至8°C下至少可以放置一周,在-5至-20°C至少可以放置一年。