需要试剂:
氯仿、异丙醇、75%乙醇(用DEPC水配制)、RNase free 水、组织匀浆。
操作步骤:
1、样本处理
(1)取出高温高压消毒后研钵,切取 50-100mg冰冻组织置于研钵内,倒入液氮,研碎;
(2)每50-100mg均浆组织标本中加入1ml的高效TRIZOL裂解液,标本的量不能超过
高效TRIZOL裂解液 体积的 10%,否则会出现 DNA 污染;
(3)将以上匀浆标本转移到1.5ml的EP管中,在15-30℃放置5min,以彻底分离核蛋白复合体;
2、相分离
加入0.2 ml的氯仿,加盖好后用手剧烈摇晃15s,在15-30°C放置2-3min,然后离心
12,000xg,15min;离心后分成三层,取上层水相。RNA只存在于水相中,水相占总体积 的 60%。
3、RNA 沉淀
将上层水相转移到另一干净的 EP管中,加入0.5ml异丙醇,15-30℃,静置10min,然后
12,000xg,4°C离心10min。离心前可以在管的侧壁和底部看到絮状胶样沉淀,这就是 RNA 沉淀。
4、RNA 洗涤
去上清,加入1ml 75%乙醇洗涤RNA沉淀,振荡器混匀,7,500xg,4℃离心5min.
5、RNA 再溶解
去上清,置真空或空气中 5-10min,干燥 RNA沉淀。注意不能将 RNA沉淀完全干燥,这样会极
大地降低它的溶解度。部份溶解的RNA样品其 A260/280 比值<1。用无 RNase 水或 0.5% SDS
溶液重悬 RNA沉淀,用枪头反复吹打几次,55-60°C,静置10min。测浓度后-20℃保存。
6、测浓度
取2μl储存液加入另一个EP管中,再加入98μl无RNase水,离心混匀,以无RNase水作空白对
照,测OD260/280值。0D260/280 值在1.8-2.0视为纯度很高。
●一般浓度在1000ng/μI较准。浓度太高要稀释以后再测定。
●RNA鉴定:琼脂糖电泳,确定抽提RNA完整性和DNA污染情况。
【注意事项】
在使用高效TRIZOL裂解液的时候要带手套和眼罩,避免接触到皮肤和衣服,使用化学通风橱,防止蒸汽吸入。
除非特别说明,所有的操作均在 15-30°C下进行,所用的试剂均放置于15-30°C。
组织在加入氯仿之前是可以在-60至-70°C放置一个月。RNA沉淀在75%乙醇中在2至8℃下至少可以放置一周,
在-5至-20℃至少可以放置一年。